1- الإدارة المركزية لشئون التصدير والاستيراد وتتكون من الإدارات العامة التالية:

 - الإدارة العامة لشئون الاستيراد والتصدير

 - الإدارة العامة لقضايا الاستيراد والتصدير

 - الإدارة العامة لمكتب التجارة الخارجية بميناء القاهرة الدولي

 -  الإدارة العامة لمكتب التجارة الخارجية بميناء الاسكندرية

 - الإدارة العامة لمكتب التجارة الخارجية بميناء بور سعيد ودمياط

 - الإدارة العامة لمكتب التجارة الخارجية لميناء السويس

 - الإدارة العامة لشئون المجالس التصديرية ومجالس الأعمال

2- الإدارة المركزية لمنظمة التجارة العالمية وتتكون من الإدارات العامة التالية:

 - الإدارة العامة لقواعد المنظمة

 - الإدارة العامة لتجارة السلع

 - الإدارة العامة لتجارة الخدمات

 - الإدارة العامة لخدمات المنظمة

 - الإدارة العامة لحماية الملكية الفكرية

3- الإدارة المركزية للاتفاقيات التجارية وتتكون من الإدارات العامة التالية:

 - الإدارة العامة لقواعد المنشأ

 - الإدارة العامة للاتفاقيات الإقليمية

 - الإدارة العامة للاتفاقيات الثنائية

 - الإدارة العامة للمعاملة الجمركية والإفراج

4- الإدارة العامة للغرف التجارية